В Российской Федерации зарегистрированы и действуют 56 региональных и 23 местных отделений Кыргызского Конгресса.

Региональные отделения Кыргызского Конгресса ведут активную работу: по всей стране активно взаимодействуют с федеральными и местными органами власти, ведут волонтерскую деятельность по поддержке социально незащищенных граждан, оказывают помощь лицам, находящимся в трудной жизненной ситуацией, как соотечественникам, так и за рубежом. Отмечаются исторические даты и национальные праздники, и другие культурные мероприятия.